Entlebucher Mountain Dog Members

Dogs

Entlebucher Mountain Dog

* Available as custom analyses. Contact us for details.

Genetic Diversity
Traits & Disorders
Genetic Ranks
Genetic Structure
Kinship
ROH
Traits*
Health*
mtDNA & Y Haplotypes*
PCA*
Genetic Diversity

Genetic Diversity

	ICB Code	Inbreeding (F)	Inbreeding (Fis)	Mean Kinship (mK)	Heterozygosity (ho)
wdt_ID	ICB Code	Inbreeding (F)	Inbreeding (Fis)	Mean Kinship (mK)	Heterozygosity (ho)
1	ENT-101045	0.380	-0.001	0.366	0.177
2	ENT-101049	0.411	0.024	0.314	0.174
3	ENT-101060	0.457	0.113	0.343	0.158
4	ENT-101069	0.427	0.059	0.329	0.168
5	ENT-101095	0.367	-0.085	0.309	0.194
6	ENT-101097	0.313	-0.113	0.316	0.198
7	ENT-101102	0.285	-0.228	0.376	0.219
8	ENT-101105	0.394	-0.017	0.325	0.182
9	ENT-101129	0.382	-0.003	0.297	0.179
10	ENT-101154	0.408	-0.001	0.318	0.179
11	ENT-101160	0.386	-0.056	0.335	0.189
12	ENT-101165	0.359	-0.032	0.340	0.182
13	ENT-101251	0.439	0.064	0.324	0.167
14	ENT-101280	0.349	-0.077	0.328	0.192
15	ENT-101282	0.397	0.003	0.313	0.178
16	ENT-101287	0.357	-0.046	0.307	0.187
17	ENT-101295	0.434	0.043	0.378	0.171
18	ENT-101297	0.402	-0.010	0.362	0.180
19	ENT-101303	0.407	0.045	0.321	0.170
20	ENT-101305	0.437	0.093	0.321	0.162
21	ENT-101310	0.439	0.047	0.308	0.170
22	ENT-101311	0.443	0.053	0.327	0.169
23	ENT-122101001	0.494	0.184	0.264	0.146
24	ENT-1391024290	0.358	-0.093	0.361	0.195
25	ENT-1919100353	0.428	0.065	0.295	0.167
26	ENT-1919104467	0.392	-0.009	0.325	0.180
27	ENT-1919106096	0.446	0.079	0.306	0.165
28	ENT-1919108457	0.356	-0.073	0.350	0.191
29	ENT-1919109168	0.383	-0.053	0.323	0.188
30	ENT-191919018	0.422	0.007	0.328	0.177
31	ENT-21211371109	0.376	-0.008	0.303	0.180
32	ENT-21211371116	0.401	0.035	0.341	0.172
33	ENT-21211371122	0.416	0.031	0.308	0.173
34	ENT-212128511	0.329	-0.052	0.343	0.188
35	ENT-212136613	0.435	0.070	0.326	0.166
36	ENT-23235455	0.410	0.029	0.340	0.173
37	ENT-2428445	0.386	-0.024	0.321	0.183
38	ENT-2503925	0.358	-0.039	0.330	0.185
39	ENT-2539565	0.340	-0.057	0.327	0.189
40	ENT-2600030	0.448	0.091	0.317	0.162
41	ENT-2612525	0.388	-0.024	0.305	0.182
42	ENT-2619987	0.345	-0.123	0.294	0.200
43	ENT-2682950	0.423	0.039	0.325	0.172
44	ENT-2689227	0.390	-0.017	0.327	0.181
45	ENT-2712129	0.419	0.048	0.306	0.170
46	ENT-2712131	0.418	0.038	0.325	0.172
47	ENT-2712132	0.393	-0.021	0.327	0.182
48	ENT-2724612	0.416	0.011	0.321	0.177
49	ENT-2732474	0.436	0.032	0.350	0.173
50	ENT-2732479	0.413	0.016	0.350	0.176
51	ENT-2734735	0.462	0.105	0.335	0.160
52	ENT-2738049	0.445	0.091	0.309	0.162
53	ENT-2738053	0.396	-0.008	0.326	0.180
54	ENT-2747446	0.409	0.000	0.311	0.178
55	ENT-2749456	0.432	0.028	0.315	0.174
56	ENT-2749458	0.386	-0.040	0.299	0.185
57	ENT-276033	0.312	-0.092	0.309	0.195
58	ENT-2763521	0.384	-0.016	0.331	0.181
59	ENT-2763527	0.403	0.002	0.342	0.178
60	ENT-2799401	0.380	-0.022	0.308	0.182
61	ENT-2803817	0.368	-0.061	0.279	0.189
62	ENT-2822733	0.450	0.112	0.290	0.158
63	ENT-2822736	0.479	0.155	0.292	0.151
64	ENT-2822737	0.418	0.029	0.316	0.173
65	ENT-2831018	0.392	-0.023	0.333	0.182
66	ENT-2842753	0.370	-0.078	0.334	0.192
67	ENT-2856648	0.354	-0.040	0.279	0.185
68	ENT-2856650	0.311	-0.180	0.308	0.211
69	ENT-2861315	0.375	-0.069	0.332	0.191
70	ENT-2869980	0.445	0.063	0.336	0.167
71	ENT-2870936	0.374	-0.048	0.342	0.187
72	ENT-2870937	0.394	-0.003	0.320	0.179
73	ENT-2913916	0.370	-0.077	0.340	0.192
74	ENT-2943754	0.382	-0.055	0.350	0.188
75	ENT-2998051	0.388	-0.038	0.332	0.185
76	ENT-32320006	0.439	0.085	0.330	0.163
77	ENT-34391	0.407	0.020	0.321	0.175
78	ENT-34445	0.425	0.010	0.329	0.177
79	ENT-34724	0.409	-0.003	0.324	0.179
80	ENT-35758	0.410	0.009	0.356	0.177
81	ENT-35975	0.398	-0.001	0.323	0.179
82	ENT-37360	0.385	-0.068	0.342	0.191
83	ENT-37380	0.430	0.024	0.297	0.174
84	ENT-38104	0.389	-0.004	0.341	0.179
85	ENT-38786	0.370	-0.047	0.327	0.187
86	ENT-38902	0.414	-0.004	0.355	0.179
87	ENT-39289	0.403	-0.003	0.348	0.179
88	ENT-39439	0.335	-0.141	0.231	0.204
89	ENT-39466	0.400	0.000	0.324	0.179
90	ENT-40028	0.346	-0.120	0.325	0.200
91	ENT-40200	0.387	-0.043	0.356	0.186
92	ENT-40202	0.396	-0.021	0.352	0.182
93	ENT-40590	0.377	-0.062	0.359	0.190
94	ENT-40702	0.421	0.043	0.341	0.171
95	ENT-41111	0.397	0.002	0.287	0.178
96	ENT-41500	0.391	-0.039	0.354	0.185
97	ENT-41533	0.336	-0.068	0.330	0.191
98	ENT-41803	0.354	-0.092	0.329	0.195
99	ENT-41961	0.374	-0.080	0.369	0.193
100	ENT-42325	0.352	-0.112	0.341	0.199
101	ENT-42436	0.412	-0.025	0.352	0.183
102	ENT-42491	0.414	0.046	0.350	0.170
103	ENT-42532	0.451	0.104	0.356	0.160
104	ENT-42534	0.441	0.088	0.349	0.163
105	ENT-42576	0.431	0.050	0.301	0.170
106	ENT-42580	0.404	-0.012	0.308	0.181
107	ENT-42779	0.392	0.011	0.318	0.177
108	ENT-43054	0.322	-0.140	0.341	0.204
109	ENT-43055	0.342	-0.138	0.303	0.203
110	ENT-43211223	0.431	0.049	0.335	0.170
111	ENT-43298	0.408	-0.012	0.348	0.181
112	ENT-43601	0.424	0.039	0.337	0.172
113	ENT-43669	0.403	-0.028	0.344	0.184
114	ENT-43743	0.397	0.008	0.320	0.177
115	ENT-43802	0.393	0.000	0.336	0.179
116	ENT-43888	0.368	-0.055	0.322	0.188
117	ENT-43899	0.419	0.036	0.281	0.172
118	ENT-44024	0.368	-0.065	0.337	0.190
119	ENT-44331002	0.412	0.036	0.339	0.172
120	ENT-44361	0.398	-0.009	0.313	0.180
121	ENT-44538	0.366	-0.054	0.318	0.188
122	ENT-44628	0.346	-0.105	0.329	0.197
123	ENT-44761	0.380	-0.074	0.365	0.192
124	ENT-44765	0.425	-0.005	0.311	0.180
125	ENT-44767	0.474	0.135	0.310	0.155
126	ENT-44779	0.440	0.065	0.348	0.167
127	ENT-44783	0.438	0.054	0.348	0.169
128	ENT-44813	0.433	0.037	0.344	0.172
129	ENT-45050	0.368	-0.079	0.329	0.193
130	ENT-45208	0.380	-0.039	0.341	0.186
131	ENT-45400	0.413	0.016	0.330	0.176
132	ENT-45401	0.417	0.037	0.318	0.172
133	ENT-45670	0.393	-0.009	0.365	0.180
134	ENT-45672	0.404	-0.014	0.347	0.181
135	ENT-45756	0.375	-0.063	0.321	0.190
136	ENT-45821	0.384	-0.052	0.353	0.188
137	ENT-45984	0.367	-0.057	0.369	0.189
138	ENT-45989	0.360	-0.100	0.331	0.196
139	ENT-46079	0.423	0.043	0.275	0.171
140	ENT-46111	0.463	0.111	0.360	0.159
141	ENT-46112	0.402	-0.024	0.372	0.183
142	ENT-46317	0.407	0.015	0.329	0.176
143	ENT-46320	0.413	0.031	0.350	0.173
144	ENT-46323	0.406	-0.012	0.359	0.181
145	ENT-46410	0.450	0.082	0.347	0.164
146	ENT-46475	0.387	-0.035	0.339	0.185
147	ENT-46622	0.434	0.053	0.359	0.169
148	ENT-46625	0.451	0.092	0.342	0.162
149	ENT-46751	0.376	-0.075	0.335	0.192
150	ENT-46757	0.405	-0.016	0.325	0.181
151	ENT-46762	0.208	-0.101	0.327	0.197
152	ENT-46810	0.491	0.185	0.318	0.145
153	ENT-47014	0.400	-0.026	0.337	0.183
154	ENT-47209	0.411	0.022	0.346	0.175
155	ENT-47224	0.432	0.043	0.328	0.171
156	ENT-47290	0.332	-0.148	0.315	0.205
157	ENT-47459	0.399	-0.038	0.344	0.185
158	ENT-47518	0.374	-0.106	0.357	0.198
159	ENT-47618	0.374	-0.083	0.347	0.193
160	ENT-47685	0.390	-0.022	0.320	0.182
161	ENT-47775	0.466	0.097	0.324	0.161
162	ENT-48054	0.356	-0.099	0.344	0.196
163	ENT-48058	0.442	0.093	0.340	0.162
164	ENT-48154	0.385	-0.042	0.353	0.186
165	ENT-48155	0.381	-0.038	0.362	0.185
166	ENT-48157	0.413	0.006	0.354	0.177
167	ENT-48160	0.446	0.083	0.337	0.164
168	ENT-48161	0.391	-0.014	0.342	0.181
169	ENT-48165	0.424	0.048	0.337	0.170
170	ENT-48193	0.334	-0.093	0.307	0.195
171	ENT-48232	0.402	0.007	0.346	0.177
172	ENT-48639	0.429	0.068	0.347	0.167
173	ENT-48645	0.403	0.009	0.335	0.177
174	ENT-49009	0.396	0.016	0.326	0.176
175	ENT-49014	0.382	-0.038	0.345	0.185
176	ENT-49016	0.377	-0.026	0.319	0.183
177	ENT-49210	0.423	0.037	0.346	0.172
178	ENT-49219	0.346	-0.110	0.348	0.198
179	ENT-49231	0.390	-0.062	0.333	0.190
180	ENT-49365	0.445	0.061	0.353	0.168
181	ENT-49702	0.390	-0.031	0.362	0.184
182	ENT-49704	0.421	0.035	0.328	0.172
183	ENT-49775	0.385	-0.027	0.362	0.183
184	ENT-49776	0.401	-0.013	0.374	0.181
185	ENT-49869	0.419	0.020	0.310	0.175
186	ENT-49909	0.363	-0.080	0.313	0.193
187	ENT-50172	0.372	-0.071	0.341	0.191
188	ENT-50177	0.342	-0.119	0.343	0.200
189	ENT-50229	0.390	-0.030	0.317	0.184
190	ENT-50410	0.399	0.000	0.326	0.178
191	ENT-50547	0.415	0.005	0.336	0.178
192	ENT-50550	0.458	0.100	0.310	0.161
193	ENT-50599	0.398	-0.001	0.335	0.178
194	ENT-50664	0.367	-0.074	0.348	0.192
195	ENT-50665	0.415	0.034	0.326	0.173
196	ENT-50668	0.386	-0.029	0.329	0.184
197	ENT-50669	0.393	-0.033	0.330	0.184
198	ENT-50723	0.425	0.018	0.341	0.175
199	ENT-50724	0.388	-0.023	0.352	0.183
200	ENT-50913	0.432	0.018	0.339	0.175
201	ENT-50914	0.435	0.033	0.336	0.173
202	ENT-51018	0.381	-0.019	0.332	0.182
203	ENT-51023	0.389	-0.028	0.324	0.184
204	ENT-51024	0.375	-0.028	0.316	0.183
205	ENT-51027	0.397	-0.020	0.326	0.182
206	ENT-51028	0.367	-0.059	0.329	0.189
207	ENT-51035	0.398	-0.031	0.353	0.184
208	ENT-51120	0.399	0.014	0.365	0.176
209	ENT-51122	0.427	0.071	0.363	0.166
210	ENT-51123	0.421	0.069	0.350	0.166
211	ENT-51154	0.386	-0.043	0.333	0.186
212	ENT-51507	0.364	-0.063	0.334	0.190
213	ENT-51614	0.395	-0.023	0.298	0.183
214	ENT-51620	0.423	0.082	0.335	0.164
215	ENT-51671	0.398	-0.011	0.337	0.180
216	ENT-51724	0.427	0.014	0.313	0.176
217	ENT-51867	0.372	-0.033	0.325	0.184
218	ENT-52063	0.349	-0.079	0.337	0.192
219	ENT-52121104	0.437	0.088	0.293	0.163
220	ENT-52121172	0.402	-0.017	0.339	0.182
221	ENT-521211729	0.423	0.026	0.347	0.174
222	ENT-52121177	0.393	-0.004	0.322	0.179
223	ENT-5212121021	0.395	0.016	0.340	0.176
224	ENT-52121217	0.369	-0.058	0.343	0.189
225	ENT-52139	0.415	0.021	0.338	0.175
226	ENT-5222121024	0.337	-0.116	0.279	0.199
227	ENT-5222121025	0.352	-0.102	0.282	0.197
228	ENT-52257	0.415	0.006	0.325	0.177
229	ENT-52258	0.427	0.056	0.330	0.168
230	ENT-52345	0.429	0.054	0.317	0.169
231	ENT-52347	0.372	-0.071	0.353	0.191
232	ENT-52430	0.421	0.013	0.347	0.176
233	ENT-52751	0.406	0.020	0.324	0.175
234	ENT-52996	0.396	-0.006	0.351	0.180
235	ENT-52997	0.422	0.042	0.337	0.171
236	ENT-52998	0.367	-0.023	0.344	0.182
237	ENT-53001	0.385	-0.023	0.367	0.182
238	ENT-53115	0.394	-0.056	0.332	0.188
239	ENT-53226	0.403	-0.016	0.335	0.181
240	ENT-53233	0.409	0.015	0.356	0.176
241	ENT-53237	0.425	0.023	0.331	0.174
242	ENT-53239	0.386	-0.040	0.347	0.186
243	ENT-53245	0.410	0.048	0.318	0.170
244	ENT-53249	0.437	0.077	0.329	0.165
245	ENT-53301	0.402	-0.006	0.344	0.180
246	ENT-53310	0.430	0.045	0.306	0.170
247	ENT-53311	0.388	-0.042	0.324	0.186
248	ENT-53467	0.398	-0.022	0.357	0.182
249	ENT-53552	0.360	-0.055	0.345	0.188
250	ENT-53603	0.390	-0.015	0.360	0.181
251	ENT-53738	0.371	-0.055	0.314	0.188
252	ENT-53796	0.419	0.040	0.332	0.171
253	ENT-54148	0.367	-0.041	0.347	0.186
254	ENT-54484	0.383	-0.041	0.315	0.186
255	ENT-54486	0.415	0.030	0.354	0.173
256	ENT-5455455002	0.366	-0.081	0.324	0.193
257	ENT-55329	0.350	-0.097	0.293	0.196
258	ENT-55365	0.385	-0.035	0.324	0.185
259	ENT-55370	0.408	0.022	0.297	0.174
260	ENT-55503	0.403	0.008	0.316	0.177
261	ENT-55791	0.359	-0.030	0.329	0.184
262	ENT-55793	0.413	0.012	0.319	0.176
263	ENT-55889	0.360	-0.020	0.307	0.182
264	ENT-56042	0.354	-0.060	0.329	0.189
265	ENT-56082	0.395	-0.017	0.335	0.181
266	ENT-56231	0.449	0.082	0.319	0.164
267	ENT-56378	0.439	0.055	0.345	0.169
268	ENT-56386	0.364	0.056	0.321	0.169
269	ENT-56777	0.382	-0.011	0.344	0.181
270	ENT-5678121	0.115	-0.541	0.196	0.275
271	ENT-567856007	0.429	0.050	0.336	0.170
272	ENT-57124	0.389	-0.021	0.345	0.182
273	ENT-57408	0.370	-0.047	0.330	0.187
274	ENT-57410	0.368	-0.065	0.340	0.190
275	ENT-57775	0.376	-0.046	0.352	0.187
276	ENT-57790	0.399	0.014	0.343	0.176
277	ENT-58064	0.346	-0.127	0.345	0.201
278	ENT-58352	0.403	-0.024	0.314	0.183
279	ENT-58850	0.386	0.020	0.330	0.175
280	ENT-59066	0.342	-0.139	0.319	0.203
281	ENT-59253	0.380	-0.065	0.356	0.190
282	ENT-59256	0.009	-0.101	0.270	0.201
283	ENT-626123322	0.350	-0.080	0.312	0.193
284	ENT-6634	0.382	-0.048	0.350	0.187
285	ENT-7162	0.460	0.113	0.351	0.158
286	ENT-7295	0.395	0.014	0.301	0.176
287	ENT-7317	0.376	-0.064	0.345	0.190
288	ENT-7368	0.419	0.015	0.345	0.176
289	ENT-7449	0.377	-0.052	0.361	0.188
290	ENT-7685	0.339	-0.106	0.286	0.197
291	ENT-7781	0.340	-0.104	0.323	0.197
292	ENT-7792	0.395	0.000	0.344	0.178
293	ENT-7793	0.417	0.038	0.341	0.172
294	ENT-7828	0.414	0.017	0.339	0.176
295	ENT-7834	0.382	-0.039	0.346	0.185
296	ENT-7843	0.377	-0.058	0.363	0.189
297	ENT-7908	0.391	-0.029	0.328	0.184
298	ENT-7912121015	0.420	0.026	0.312	0.174
299	ENT-7915	0.375	-0.045	0.330	0.186
300	ENT-7953	0.409	0.018	0.327	0.175
301	ENT-7956	0.415	0.009	0.368	0.177
302	ENT-7967	0.396	0.009	0.349	0.177
303	ENT-7990	0.410	0.016	0.344	0.176
304	ENT-7996	0.363	-0.088	0.348	0.194
305	ENT-7997	0.364	-0.085	0.356	0.194
306	ENT-8000	0.361	-0.100	0.357	0.196
307	ENT-8001	0.348	-0.079	0.339	0.192
308	ENT-8006	0.424	0.039	0.322	0.172
309	ENT-8044	0.367	-0.068	0.343	0.191
310	ENT-8046	0.470	0.107	0.330	0.160
311	ENT-8078	0.368	-0.061	0.321	0.189
312	ENT-8083	0.357	-0.096	0.369	0.196
313	ENT-8095	0.365	-0.056	0.320	0.188
314	ENT-8122	0.429	0.045	0.332	0.171
315	ENT-8148	0.419	0.021	0.329	0.175
316	ENT-8149	0.379	-0.052	0.349	0.188
317	ENT-8152	0.436	0.064	0.311	0.167
318	ENT-8163	0.415	0.047	0.323	0.170
319	ENT-8180	0.360	-0.059	0.319	0.189
320	ENT-8186	0.421	0.052	0.332	0.169
321	ENT-8201	0.412	0.026	0.331	0.174
322	ENT-8204	0.394	-0.015	0.333	0.181
323	ENT-8219	0.344	-0.119	0.337	0.200
324	ENT-8292	0.406	0.006	0.346	0.178
325	ENT-8312	0.304	0.026	0.330	0.170
326	ENT-8331	0.388	-0.046	0.315	0.187
327	ENT-8349	0.390	-0.039	0.358	0.186
328	ENT-8351	0.400	-0.002	0.338	0.179
329	ENT-8352	0.364	-0.037	0.337	0.185
330	ENT-8430	0.404	-0.010	0.327	0.180
331	ENT-8440	0.362	-0.084	0.321	0.194
332	ENT-8469	0.359	-0.068	0.313	0.191
333	ENT-8470	0.403	0.003	0.339	0.178
334	ENT-8473	0.383	-0.039	0.320	0.185
335	ENT-8491	0.425	0.045	0.334	0.170
336	ENT-8508	0.376	-0.059	0.355	0.189
337	ENT-8520	0.449	0.109	0.320	0.159
338	ENT-8527	0.386	-0.013	0.350	0.180
339	ENT-8545	0.375	-0.009	0.318	0.180
340	ENT-8552	0.387	-0.025	0.339	0.183
341	ENT-8559	0.412	0.030	0.327	0.173
342	ENT-8569	0.360	-0.086	0.339	0.194
343	ENT-8575	0.452	0.095	0.337	0.161
344	ENT-8592	0.383	-0.022	0.330	0.182
345	ENT-8599	0.437	0.072	0.342	0.166
346	ENT-8600	0.452	0.085	0.309	0.163
347	ENT-8601	0.420	0.043	0.321	0.171
348	ENT-8627	0.416	0.071	0.297	0.166
349	ENT-8629	0.422	0.043	0.328	0.171
350	ENT-8631	0.402	0.028	0.329	0.173
351	ENT-8632	0.445	0.102	0.301	0.160
352	ENT-8633	0.417	0.022	0.336	0.174
353	ENT-8641	0.405	0.015	0.323	0.176
354	ENT-8646	0.365	-0.080	0.366	0.193
355	ENT-8664	0.404	0.005	0.323	0.177
356	ENT-8666	0.415	0.003	0.356	0.178
357	ENT-8669	0.349	-0.120	0.388	0.200
358	ENT-8670	0.387	-0.011	0.376	0.180
359	ENT-8671	0.461	0.107	0.327	0.159
360	ENT-8677	0.362	-0.075	0.340	0.192
361	ENT-8708	0.357	-0.071	0.336	0.191
362	ENT-8751	0.431	0.047	0.309	0.170
363	ENT-8787	0.468	0.129	0.325	0.155
364	ENT-8791	0.386	-0.004	0.340	0.179
365	ENT-8814	0.403	0.026	0.331	0.174
366	ENT-8820	0.414	0.026	0.333	0.174
367	ENT-8870	0.387	-0.045	0.319	0.186
368	ENT-8872	0.434	0.074	0.348	0.165
369	ENT-8873	0.398	0.002	0.323	0.178
370	ENT-8874	0.421	0.051	0.351	0.169
371	ENT-8882	0.448	0.074	0.295	0.165
372	ENT-8907	0.369	-0.075	0.350	0.192
373	ENT-8931	0.385	-0.030	0.354	0.184
374	ENT-8974	0.392	-0.019	0.355	0.182
375	ENT-9003	0.389	0.006	0.321	0.177
376	ENT-9015	0.400	-0.001	0.330	0.179
377	ENT-9058	0.368	-0.042	0.336	0.186
378	ENT-90920385	0.389	-0.006	0.317	0.179
379	ENT-9138	0.389	-0.022	0.335	0.182
380	ENT-EN001	0.429	0.045	0.342	0.170
381	ENT-EN408	0.353	-0.091	0.361	0.195
382	ENT-EN429	0.358	-0.087	0.348	0.194
383	ENT-EN511	0.381	-0.018	0.325	0.182

Please choose input type for columns that you want to edit

wdt_ID:

ICB Code:

Inbreeding (F):

Inbreeding (Fis):

Mean Kinship (mK):

Heterozygosity (ho):

Traits & Disorders

Genetic Ranks

Sorted by rank

Ranking by Inbreeding (F)

Ranking by Inbreeding (Fis)

Ranking by Mean Kinship

Ranking by Heterozygosity

Genetic Structure

The dendrogram and heat map for genetic structure are produced from the kinship coefficients.

Kinship

Kinship Coefficient

The kinship coefficient (K) is the fraction of the genome shared by two individuals that is homozygous by descent, so it is a pairwise measure of relatedness.

This kinship matrix is color coded to identify cells in which K < 0.0625 (6.25%; green, equivalent to a cross of first cousins), K = 0.125 (12.5%; yellow, half-sib cross), and K > 0.25 (25%; red, full sib cross). The kinship coefficient between a male and female is also the predicted average inbreeding coefficient of their offspring if they produced a litter.

ROH

Runs of Homozygosity (ROH)

Inbreeding tends to produce runs (blocks) of homozygosity (ROH) on the chromosomes. Over time, the crossing-over of chromosomes during meiosis can split up blocks of homozygosity, so the largest blocks are likely to be the most recent inbreeding and smaller blocks reflect older inbreeding. ROH are used to estimate inbreeding from SNP data.

Learn more about Runs of Homozygosity.

Inbreeding: 25 generations (1000 kb)

Inbreeding: 6 generations (8000 kb)

Traits*
Health*
mtDNA & Y Haplotypes*

PCA*

Dogs